报告时间:2024年12月18日(星期三)10∶20-12:00
报告地点:2号楼208会议室
主 持 人:殷利眷 副教授、硕导
报告题目一:基于序列特征的启动子识别与强度预测
报 告 人:彭 冲 助理研究员、硕导
报告人简介:
彭冲,博士,best365官网登录下载best365体育最新版本助理研究员,硕士生导师,best365官网登录下载best365体育最新版本院青年学术委员会副主任,天津市食品学会会员,天津市科技特派员。主要研究方向为:(1)基于人工智能的蛋白质设计与改造;(2)生物信息数据库的建立;(3)工程菌高效功能元件的系统化分析与预测。研究成果发表到Frontiers in bioengineering and biotechnology,Frontiers in microbiology等期刊,曾担任Briefings in bioinformatics,Applied microbiology and biotechnology杂志审稿人。近年来,主持国家自然科学基金青年基金1项,参与国家重点研发计划专项项目2项,国家自然科学基金面上项目2项。
报告简介:
启动子作为基因表达调控的重要元件,其准确预测对于理解基因功能和潜在机制具有重要意义。本研究开发了一款新的启动子预测工具——Prompt,此工具能够在16种不同的原核生物中高效地预测启动子,并且显著提升了预测结果的可解释性。首先采用k-mer组成分析、g-gap k-mer等多种特征表示方法,全面捕捉启动子序列的关键信息。然后通过RSK、CL和MLP三种模型的学习,不仅考虑了序列本身的特性,还引入了对比学习机制,进一步提高了模型的泛化能力和预测精度。另外,通过收集数据结合本地表征,构建了枯草芽孢杆菌启动子强度数据集,选用7种自然语言处理模型预测了枯草芽孢杆菌和大肠杆菌启动子强度。
报告题目二:稀少糖关键酶的固定化及多酶级联催化的研究
报 告 人:高鑫 博士生
报告人简介:
高鑫,2021级博士生,主要致力于新型固定化酶分子的设计与制备及多酶级联反应等酶工程领域的研究;攻读博士期间在Chemical Engineering Journal、Food Chemistry、Journal of Agricultural and Food Chemistry等国际知名杂志发表论文3篇,参与SCI论文发表多篇,主持best365官网登录下载优秀博士创新资助项目,参与了国家重点研发、天津市应用基础与前沿技术研究计划等项目。
报告简介:
稀少糖D-阿洛酮糖(D-allulose)是一种理想的低能量甜味剂替代品,其在食品加工和医疗健康领域具有广泛的应用前景。生物酶法合成D-阿洛酮糖的过程中,游离酶不稳定、纯化成本高及无法回收等弊端严重阻碍了其在生物转化中的广泛应用。本研究聚焦于开发针对D-阿洛酮糖生物法制备的新型酶催化剂。针对传统固定化方法自身的弊端-固定化后酶活性口袋朝向的随机性,设计酶的定向固定化新策略,实现酶分子被固定化后精准的空间调控及高效的催化特性,突破固定化后酶催化活性下降的壁垒。同时,基于酮糖3-差向异构酶的家族酶催化特性,结合杂化纳米花固定化方法,定制关键酶的固定化新策略,成功制备催化活性高、耐酸性强的固定化酶,拓宽了固定化关键酶的工业应用场景,并首次在分子层面揭示了纳米固定化酶活性提高的机理以及酸性耐受性提高的分子机制。进一步地,本研究设计了针对多酶级联催化反应体系的蛋白支架,构建了体内与体外多酶自组装的催化平台,实现了以D-果糖为出发底物的D-阿洛酮糖的高效全部合成。
报告题目三:木葡糖酸醋杆菌中表达元件与编辑系统的开发及应用研究
报 告 人:彭昭君 博士生
报告人简介:
彭昭君,best365官网登录下载best365体育最新版本轻工技术与工程专业2020级博士研究生,导师钟成教授,主要致力于木葡糖酸醋杆菌中表达元件与编辑系统的开发及应用研究。博士期间主持best365官网登录下载研究生科研创新项目一项,发表SCI论文两篇(1篇1区top,1篇2区)。
报告简介:
细菌纤维素(BC)是一种由微生物合成的多糖,其通过β-1,4-糖苷键连接葡萄糖单元形成。与植物来源的纤维素相比,BC具有更高的纯度、结晶度、良好的保水性、卓越的机械性能以及独特的3D纳米纤维结构。这些特性赋予了BC在能源、环境、食品和生物医学等领域广泛应用的潜力。为了使BC的生产规模能够满足这些领域的需求,深入研究BC的合成机制并提升其产量至关重要。本研究在BC生产菌株中建立了启动子文库及基于SacB的基因编辑工具,并借助遗传工具对细菌纤维素合酶的功能进行解析,以及利用代谢工程进一步提升了BC产量。
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研究生教务科&青年学术委员会
2024年12月12日